Авиакомпания «Когалымавиа» формально зарегистрирована в г. Когалым Тюменской области, но головной офис находится в Сургуте, откуда и выполнялось большинство регулярных рейсов. Но полеты из Сургута были прекращены ввиду их экономической нецелесообразности. С одной стороны, парк самолетов Ту-154, который есть у «Когалымавиа», достаточно устарел и требует значительных вложений на поддержание летной годности, а, с другой, авиакомпания «ЮТЭйр», также работающая в Сургуте, практически монополизировала выполнение всех рейсов для обслуживания нефтедобывающей промышленности.